Dirección General:
Se encarga de dirigir, coordinar y articular los esfuerzos de las instituciones y organismos comprometidos con la protección, prevención, atención, intervención y/o seguimiento de las víctimas de violencia.

Asesoría Legal:
Se encarga de favorecer la atención y prevención de la violencia a través de la orientación y de la investigación y redirección de casos cuyo proceso legal ha sido afectado irregularmente.

Departamento de Ejecución:
Es el núcleo generador de la DNAV. Combina divisiones especializadas que laboran coordinadamente en la producción de los proyectos, recursos y herramientas dirigidas a la protección, prevención, atención, intervención y/o seguimiento de las víctimas de violencia. Le componen:
División de Planificación e Investigación de Proyectos:
Se encarga de la planificación y estructuración de todos los proyectos que fundamentan y delimitan el alcance y la factibilidad de las acciones llevadas a cabo por la DNAV. Además, es responsable de dirigir ecuánimemente las investigaciones que cimientan su ejecución garantizando la fiabilidad y disponibilidad de sus resultados.
División de Desarrollo y Promoción de Proyectos:
Es responsable del desarrollo programado, del mantenimiento y del acometimiento acertado de los objetivos y compromisos adoptados por la DNAV. Además, se encarga de dirigir, coordinar y articular las relaciones, actividades y demandas publicitarias derivadas de la naturaleza, principios y objetivos de la DNAV.

Área de Logística e Investigaciones:
Se encarga de realizar las investigaciones, documentar las ejecuciones y disponer las informaciones pertinentes acorde a lo programado y en torno a los objetivos pautados.

Área de Informática y Estadística:
Es responsable del análisis y almacenamiento de los datos, del manejo de las bases de datos y de la emisión de estadísticas respecto a las áreas de ejecución de la DNAV, a sus objetivos y la integridad con la que estos fueron obtenidos.

Área de Promoción y Relaciones Públicas:
Se encarga del diseño y reproducción de los materiales e instrumentos que sirven de apoyo en el desarrollo de los proyectos, programas y actividades de la DNAV.

División de Atención y Prevención de la Violencia:
Es responsable de implantar y mantener las determinaciones establecidas por la DNAV en todas las dependencias y de coordinar la admisión y/o aplicación de las mismas en las demás entidades involucradas en la atención de víctimas de violencia.

Coordinación local y nacional:
Es el mecanismo auxiliar del departamento de Ejecución que sirve de contacto estratégico entre DNAV y las instancias locales y nacionales de atención, representa los intereses y las atribuciones de la Dirección a la vez que sirve de informante respecto a las necesidades, conflictos y condiciones que en ellas surgen.